園長は元々青島に脳移植して寿命を伸ばしつつトキオの子が成長してからトキオの子に脳移植するつもりだったんだよね?
ナタの身体に脳移植したのは空爆の時にトキオの固体化に巻き込まれて腕を切断しなきゃいけないからであってナタ(ミクラ)になることが最終目的ではない

マルをキルコに預けた時のミクラは、園長ではなくナタの脳が戻されたナタ本人なのでは?
園長の脳はすでにヤマトの身体に移植済みとか?

そう考えると思い当たる事も多いような…