税務署員で判断できないケースは内部で国税へ問い合わせた上での回答になることが多いので、時間がかかったり、後日回答になることもありますので直接が間違いないです。
いずれにせよ、こちらの個人情報も把握されますが、やましい事がなければ心配する必要はありませんし、逆にお墨付きを貰うようなもので安心感があると思います。