◆質問◆
BTC1枚を50万円で購入し、BTC1枚が200万円になったときに50万円分(0.25BTC)だけ売りました。
投資額と同じ50万なので、利益は0で非課税ですよね？

◇回答◇
違います。
37.5万円の利益が出ているため課税対象です。

投資額が何円でも、売った0.25BTCの取得価格だけが利益計算時における費用になります。

(売却時の1枚分の価格 - 取得時の1枚分の価格) × 売却枚数 = 損益 です。

質問例では
(200万 - 50万) × 0.25 = 37.5万
となるので37.5万円の利益となります。