あー読み返したら勘違いしてたわ

ミクラはクローン体消失薬があったから、トキオJr.の特殊能力も本当だと確信したんだ。
だから危険な人喰いを始末する兵器がほしくて「何とか…トキオくんの子でもクローンでもどっちでもいいから(ほしい)」って台詞なんだ。
だからミクラは本物もクローンも特殊能力持ちだと思ってるわけだ。
どっちでも良いのか能力さえあれば。どっちかわからんが片方の赤ん坊の居場所のヒントが出たから希望を持ったのか。

ミーナはこっそりクローンの因子から特殊能力を取り除いててもおかしくないけど、それならわざわざ猿渡にトキオの子の隠れた特殊能力を教える必要もないよなあ。

そんでこれからマルに出会うまでに、
どうしてもクローンを消さなきゃいけない事情が判明したのかな。
ミクラがマルに注射したとは書いてないから、この時点ではミクラはマルはクローンではないと確信したぽい？