百合でヘテロエンドも、独立エンドも有りとは思うけど、
売れないでしょ。
やが君に関しては、作者も編集も2人が結ばれる＆男キャラは
邪魔しない方向で進めているからね。
そしてそれが受けて売れてしまった、今更変なエンドは無理だよ、
漫画家は自営業でも、編集は会社員だから会社の信用問題になる。
アニメもそこそこ売れ、漫画もヒットし始めた今、
大多数の人が望んでいる展開にして世に残さないと。