作戦だったんスよ、は成功した上で父親（元親）が生きてる場合に限る
それも裏切った本人ではなく命じた親父があれ作戦だったんスよ、と言わなきゃ誰も信じてくれない。命乞いとしか取られない

どの道、あの作戦を成功させられなかったから裏切った奴は責任取って腹を切った
父親が息子にあれ作戦なんスよ、と説明した所で裏切りの件でなく作戦失敗の件で腹を切らせるしかない

どちらにせよ終わってんなら真実を話して息子に余計な心労を与えるより、裏切り者としてスパッと介錯させた方がスッキリする。お互いにとって